四川大學生物工程專業在集成原輕紡與食品學院輕工生物技術與原化學工程學院的生物工程專業本科教學優勢資源的基礎，擬通過多學科交叉確定的該專業的兩個特色專業方向，分別是輕工生物技術和生物化工與制藥方向。輕工生物技術方向的專業課程與實踐教學在輕紡與食品學院實施，生物化工與制藥方向，在化學工程學院實施。我院的生物工程輕工生物技術方向通過生物化學、微生物學、生化分離工程、生化反應工程、發酵工程原理、分子生物學、基因工程、蛋白質與酶工程等課程的學習，使學生系統掌握生物工程領域的知識及分析復雜工程問題與產品開發的方法和技能。在本科高年學生提供參與教師科研活動的機會，使學生在應用系統生物學、代謝調控等先端生物技術的能力獲得進一步的體系，提升學生從事科研、工程設計和生產工藝的管理能力。畢業時能勝任在生物工程、輕化工程、食品及環境保護等領域的技術開發、工藝管理及工程設計等工作。
